Asa-yı Musa'da inanç ve bilim arasındaki ilişki, Bediüzzaman Said Nursi tarafından derinlemesine incelenmektedir. Nursi, inancın bilimle çatışmadığını, aksine bilimin inançları destekleyebileceğini savunur. Bilimsel gerçeklerin, inançlı bir yaşam tarzıyla harmanlanarak bireylere daha derin bir anlayış kazandırabileceği düşüncesini işler. Bu bağlamda, okuyucularına, inançlarının yalnızca bir dogma olmadığını, aynı zamanda akıl ve mantıkla desteklenmesi gereken bir sistem olduğunu hatırlatır.