Baba İshak'ın mücadelesi, günümüzde adalet, eşitlik ve inanç özgürlüğü gibi toplumsal sorunların hala geçerliliğini koruduğunu gösterir. Bu eser, bireylerin inançları uğruna verdikleri mücadelelerin yanı sıra, toplumda var olan adaletsizliklere karşı durma cesaretini vurgular. Günümüzde de benzer sorunlarla karşılaşan topluluklar, Baba İshak'ın direnişini örnek alarak, hakları için mücadele etmeye devam etmektedir. Böylece, romanın temaları, tarihsel bir bağlamdan günümüze uzanan evrensel bir mesaj taşır.