Bilimsel düşünme becerilerini geliştirmek için en etkili yöntemler arasında sorgulayıcı yaklaşım ve deney yapma yer alır. Çocukların merak ettikleri konular hakkında sorular sorması teşvik edilmeli, bu sorulara yanıt bulmaları için araştırma yapmaları sağlanmalıdır. Ayrıca, deneysel öğrenme yoluyla, çocuklar teorik bilgileri pratiğe dökme fırsatı bulurlar. Grup çalışmaları ve tartışmalar, sosyal etkileşim yoluyla farklı bakış açılarını değerlendirmelerine yardımcı olur. Böylece, çocuklar hem bireysel hem de toplumsal düzeyde bilimsel düşünmeyi öğrenirler.