Cemaleddin Afgani'nin düşünceleri, günümüzde hala tartışılmakta ve etkisini sürdürmektedir. Özellikle modernleşme, din ve bilim arasındaki ilişki, toplumsal reformlar ve özgürlük arayışı konularında Afgani'nin fikirleri, günümüz toplumları için geçerliliğini korumaktadır. Onun, İslam dünyasında reform ve aydınlanma çağrısı, günümüzdeki birçok düşünür ve aktivist tarafından benimsenmekte ve tartışılmaktadır. Afgani'nin çağrısının günümüzdeki yansımaları, özellikle genç nesillerin düşünce yapısında ve sosyal hareketlerde gözlemlenmektedir. Bu bağlamda, Afgani'nin mirası, günümüz dünyasında aydınlanma ve özgürlük arayışının bir sembolü haline gelmiştir.