Cerrahiyetül Haniye, modern cerrahinin temellerini atan önemli bir kaynak olmasının yanı sıra, günümüzdeki cerrahi uygulamalar üzerinde de etkili olmuştur. Sabuncuoğlu'nun geliştirdiği teknikler ve yöntemler, çağdaş cerrahinin bazı alanlarında hâlâ kullanılmaktadır. Ayrıca, eser, tıbbın tarihsel gelişimini anlamak isteyen cerrahlar ve tıp öğrencileri için bir referans noktasıdır. Günümüzde, cerrahların etik sorumlulukları ve hastalarla olan ilişkileri, Sabuncuoğlu'nun eserinde ele alınan felsefi ve psikolojik temellere dayandırılabilir. Bu bağlamda, kitap, geçmişten günümüze tıbbın evrimine ışık tutarak, cerrahinin insan yaşamındaki önemini vurgulamaktadır.