Descartes'ın düşünceleri, akıl ve deneyim arasındaki ilişkiyi sorgulamasıyla modern bilimsel yaklaşımın temellerini atmıştır. Günümüzde bilimsel ve felsefi tartışmalar, Descartes'ın 'şüphe etme' metodunu ve rasyonel düşünceyi temel alarak şekillenmektedir. Onun düşünceleri, özellikle epistemoloji ve ontoloji alanlarında hâlâ geçerliliğini korumakta, günümüz düşünürleri ve bilim insanları tarafından referans alınmaktadır. Descartes'ın etkisi, bilimsel yöntemin gelişimi ve felsefi sorgulama süreçlerinde kendini gösterir.