Faust'un Mephistopheles ile yaptığı anlaşma, onun özgür iradesini sorgulamasına yol açar. Anlaşma ile Faust, kısa süreli hazlar ve deneyimler peşinde koşarken, aynı zamanda kendi ruhunu tehlikeye atar. Bu durum, insanın özgür irade ile kader arasındaki ince çizgiyi sorgulamasına sebep olur. Faust, başlangıçta özgür bir seçim yaptığını düşünse de, sonuçları onu ruhsal bir boşluğa sürükler. Anlaşmanın getirdiği tatminsizlik ve içsel çatışmalar, özgür irade kavramının karmaşıklığını ortaya koyar ve insanın seçimlerinin sonuçlarıyla yüzleşmek zorunda kaldığını gösterir.