Fen bilimleri dersinde zorluk yaşanan konular genellikle enerji, madde ve canlılar ile ilgili kavramlardır. Bu konuların soyut yapısı, öğrencilerin anlamasını güçleştirebilir. Ayrıca, bu konuların günlük yaşamla bağlantısının kurulamaması da zorluk yaratabilir. Örneğin, enerji dönüşümleri veya canlıların yaşam döngüleri gibi konular, somut örneklerle desteklenmediğinde öğrenciler için karmaşık hale gelebilir. Bu nedenle, öğretim sürecinde uygulamalı etkinlikler ve deneyler bu zorlukların aşılmasında etkili olabilir.