İslam Kültür Atlası, İslam'ın evrensel değerlerine vurgu yaparak, hoşgörü, adalet ve bilgi arayışının önemini ön plana çıkarır. El-Faruki, İslam medeniyetinin tarih boyunca diğer kültürlerle olan etkileşimlerini ele alırken, bu değerlerin nasıl şekillendiğini ve toplumlar arasındaki barışın sağlanmasında ne kadar etkili olduğunu gösterir. Ayrıca, kültürel çeşitliliğin zenginlik olarak görülmesi gerektiğini savunarak, okuyucularına farklılıkların birer zenginlik kaynağı olduğunu hatırlatır.