Nöropazarlama stratejileri, tüketicilerin bilinçaltındaki motivasyonları hedef alarak, onların kararlarını etkileyebilir. Bu durum, pazarlamacıların etik sorumluluklarını sorgulamalarına neden olabilir. Özellikle, tüketicilerin manipülasyona uğrayıp uğramadığı, bilinçli seçim yapma haklarının ne ölçüde kısıtlandığı gibi konular tartışma yaratır. Pazarlamacıların, tüketiciyi yanıltmadan, bilgilendirici ve dürüst stratejiler geliştirmesi gerektiği fikri önem kazanır. Bu bağlamda, etik ve sorumluluk kavramları, nöropazarlama alanında en çok üzerinde durulması gereken konular arasında yer alır.