OHSAS standartlarının iş yerlerinde uygulanması, genellikle kaynak yetersizliği, çalışanların eğitim eksiklikleri ve yöneticilerin bu konudaki bilinç düzeylerinin yetersizliği gibi zorluklarla karşılaşmaktadır. İşverenler, iş sağlığı ve güvenliği uygulamalarını hayata geçirmek için gerekli bütçeyi ayırmakta zorlanabilirler. Ayrıca, çalışanlar bu standartlar hakkında yeterli bilgiye sahip olmayabilirler, bu da uygulamada eksikliklere yol açar. Yöneticilerin OHSAS standartlarına duyduğu ilgi ve bağlılık ise uygulamanın başarısını doğrudan etkiler. Bu nedenle, bu zorlukların üstesinden gelmek için iş yerlerinde etkili bir eğitim programı ve liderlik desteği sağlanması önemlidir.