Re'sen araştırma ilkesinin adil yargılanma hakkı üzerindeki etkileri, bu ilkenin yargı süreçlerine aktif bir katılım sağlamasıyla doğrudan ilişkilidir. Mahkemelerin, tarafların sunmadığı delilleri de dikkate alarak kendi araştırmalarını yapması, adaletin daha sağlıklı bir şekilde tesis edilmesine katkıda bulunabilir. Ancak, bu durum aynı zamanda taraflar arasındaki güveni zedeleyebilir ve tarafların mahkemeye duydukları güveni sarsabilir. Adil yargılanma hakkı, tarafların eşitliğini ve yargının tarafsızlığını gerektirirken, re'sen araştırma ilkesinin sınırlarının iyi belirlenmesi önemlidir. Bu dengenin sağlanamaması, adaletin sağlanması açısından sorunlar yaratabilir.