Türkistan Uleması, modern İslam düşüncesinin şekillenmesinde önemli bir rol oynamıştır. Onların eğitim anlayışı ve bilimsel yaklaşımları, çağdaş İslam düşünürleri üzerinde derin bir etki bırakmıştır. Ulemanın, akıl ve din arasındaki ilişkiyi sorgulaması, toplumsal meseleler karşısında geliştirdikleri çözümler, günümüzde de tartışılmakta. Ayrıca, yerel ve evrensel değerleri bir araya getirerek, modern İslam'ı anlamak için zengin bir perspektif sunmaktadırlar. Bu etki, dinî ve sosyal hayatta yenilikçi düşüncelerin filizlenmesine olanak tanımıştır.