Yapılandırmacı yaklaşım, eğitim sistemlerinde çeşitli zorluklarla karşılaşabilir. Bunlar arasında öğretmenlerin geleneksel eğitim biçimlerine alışık olmaları ve yeni yöntemleri benimsemekte tereddüt etmeleri yer alır. Ayrıca, eğitim müfredatlarının ve değerlendirme sistemlerinin hala geleneksel yaklaşımlara dayalı olması, yapılandırmacı yöntemlerin entegrasyonunu zorlaştırır. Öğrenci merkezli öğrenme ortamları oluşturmak için gerekli olan zaman ve kaynak eksikliği de bir diğer engeldir. Son olarak, yapılandırmacı yaklaşımın başarısı, öğretmenlerin yeterli eğitim ve destek almasına bağlıdır.