Zihin kontrolü, bireylerin düşüncelerini ve davranışlarını dışsal etkenler üzerinden şekillendirdiği için özgür irade kavramını sorgulatır. Bu durum, bireylerin kendi kararlarını alabilme yetilerini zayıflatabilir. Zihin kontrolü altında kalan bireyler, dışsal baskılara karşı daha savunmasız hale gelebilir ve bu da onların kendi istekleri doğrultusunda hareket etme yetilerini kısıtlayabilir. Bu bağlamda, zihin kontrolü, bireyin özgür iradesini sorgulamasına yol açan karmaşık bir süreçtir.