Babailer İsyanı, Aleviliğin tarihi, sosyal ve siyasi dinamiklerini irdeleyerek, bu inanç grubunun Osmanlı İmparatorluğu dönemindeki konumunu ele alır. Yazar, Aleviliğin köklerini, inanç sistemini ve zamanla maruz kaldığı baskıları derinlemesine inceler. İsyanın arka planındaki toplumsal eşitsizlikler, din ve devlet ilişkisi, Alevilerin maruz kaldığı ayrımcılık gibi temalar, kitabın merkezinde yer alır. Ahmet Yaşar Ocak, Aleviliğin tarihsel sürecini gözler önüne sererek, okuyucuya bu inancın ve topluluğun yaşadığı sıkıntıları anlaması için bir zemin sunar. İsyanın sadece bir başkaldırı değil, aynı zamanda kimlik arayışı ve varoluş mücadelesi olarak da değerlendirilmesi gerektiğini vurgular.